Protein–RNA interactions for Protein: Q61851

Fgfr3, Fibroblast growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr3Q61851 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr3Q61851 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgfr3Q61851 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr3Q61851 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgfr3Q61851 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fgfr3Q61851 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms