Protein–RNA interactions for Protein: Q61772

Epha7, Ephrin type-A receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha7Q61772 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epha7Q61772 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epha7Q61772 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epha7Q61772 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Epha7Q61772 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epha7Q61772 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms