Protein–RNA interactions for Protein: Q61751

Znf354a, Zinc finger protein 354A, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354aQ61751 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf354aQ61751 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf354aQ61751 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf354aQ61751 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf354aQ61751 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms