Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a3Q61327 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a3Q61327 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a3Q61327 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a3Q61327 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a3Q61327 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms