Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nab1Q61122 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nab1Q61122 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nab1Q61122 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nab1Q61122 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nab1Q61122 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms