Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d1Q60949 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d1Q60949 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d1Q60949 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d1Q60949 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d1Q60949 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms