Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin1Q60865 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin1Q60865 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Caprin1Q60865 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Caprin1Q60865 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Caprin1Q60865 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms