Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P4ha1Q60715 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
P4ha1Q60715 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
P4ha1Q60715 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P4ha1Q60715 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P4ha1Q60715 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms