Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y5T1

Zdhhc20, Probable palmitoyltransferase ZDHHC20, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc20Q5Y5T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zdhhc20Q5Y5T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zdhhc20Q5Y5T1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zdhhc20Q5Y5T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zdhhc20Q5Y5T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zdhhc20Q5Y5T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms