Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa6Q5U901 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpa6Q5U901 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpa6Q5U901 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpa6Q5U901 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpa6Q5U901 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpa6Q5U901 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpa6Q5U901 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms