Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Scaf1Q5U4C3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Scaf1Q5U4C3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Scaf1Q5U4C3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scaf1Q5U4C3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Scaf1Q5U4C3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Scaf1Q5U4C3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30,55■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Scaf1Q5U4C3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms