Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ssh2Q5SW75 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ssh2Q5SW75 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ssh2Q5SW75 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ssh2Q5SW75 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ssh2Q5SW75 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ssh2Q5SW75 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ssh2Q5SW75 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ssh2Q5SW75 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ssh2Q5SW75 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ssh2Q5SW75 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ssh2Q5SW75 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ssh2Q5SW75 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms