Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SynrgQ5SV85 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SynrgQ5SV85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SynrgQ5SV85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SynrgQ5SV85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SynrgQ5SV85 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms