Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc42Q5SV66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc42Q5SV66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc42Q5SV66 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc42Q5SV66 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms