Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdh12Q5RJH3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdh12Q5RJH3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdh12Q5RJH3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms