Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna2d4Q5RJF7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d4Q5RJF7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d4Q5RJF7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d4Q5RJF7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms