Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlha9Q5RJB0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bhlha9Q5RJB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bhlha9Q5RJB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlha9Q5RJB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms