Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp22Q5DU02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp22Q5DU02 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp22Q5DU02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp22Q5DU02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms