Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chsy3Q5DTK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chsy3Q5DTK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chsy3Q5DTK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms