Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ccdc84Q4VA36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ccdc84Q4VA36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26,58■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ccdc84Q4VA36 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Ccdc84Q4VA36 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ccdc84Q4VA36 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc84Q4VA36 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,3 ms