Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snhg11Q4G0K9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snhg11Q4G0K9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Snhg11Q4G0K9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snhg11Q4G0K9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Snhg11Q4G0K9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snhg11Q4G0K9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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