Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim26Q3V460 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim26Q3V460 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms