Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810049J17RikQ3V2G9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1810049J17RikQ3V2G9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1810049J17RikQ3V2G9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1810049J17RikQ3V2G9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810049J17RikQ3V2G9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810049J17RikQ3V2G9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810049J17RikQ3V2G9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
1810049J17RikQ3V2G9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1810049J17RikQ3V2G9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms