Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc110Q3V125 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc110Q3V125 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc110Q3V125 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms