Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn34b4Q3V0X2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldn34b4Q3V0X2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldn34b4Q3V0X2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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