Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cfap74Q3UY96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cfap74Q3UY96 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cfap74Q3UY96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cfap74Q3UY96 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cfap74Q3UY96 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cfap74Q3UY96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cfap74Q3UY96 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cfap74Q3UY96 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms