Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elf3Q3UPW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Elf3Q3UPW2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Elf3Q3UPW2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elf3Q3UPW2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Elf3Q3UPW2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms