Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf3bQ3ULL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf3bQ3ULL6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf3bQ3ULL6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf3bQ3ULL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upf3bQ3ULL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Upf3bQ3ULL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Upf3bQ3ULL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Upf3bQ3ULL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms