Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcgf5Q3UK78 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcgf5Q3UK78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcgf5Q3UK78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcgf5Q3UK78 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcgf5Q3UK78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.1 ms