Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1344.4 ms