Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Lmod2Q3UHZ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Lmod2Q3UHZ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Lmod2Q3UHZ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Lmod2Q3UHZ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lmod2Q3UHZ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lmod2Q3UHZ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lmod2Q3UHZ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lmod2Q3UHZ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lmod2Q3UHZ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lmod2Q3UHZ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lmod2Q3UHZ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lmod2Q3UHZ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms