Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LchnQ3UHG7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LchnQ3UHG7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LchnQ3UHG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LchnQ3UHG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms