Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garem1Q3UFT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Garem1Q3UFT3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Garem1Q3UFT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Garem1Q3UFT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms