Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam35aQ3UEN2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam35aQ3UEN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam35aQ3UEN2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam35aQ3UEN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam35aQ3UEN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam35aQ3UEN2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms