Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf166Q3U9F6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf166Q3U9F6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf166Q3U9F6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms