Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms