Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Vars2Q3U2A8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Vars2Q3U2A8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Vars2Q3U2A8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Vars2Q3U2A8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vars2Q3U2A8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vars2Q3U2A8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Vars2Q3U2A8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms