Protein–RNA interactions for Protein: Q3U108

Arid5a, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid5aQ3U108 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arid5aQ3U108 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Arid5aQ3U108 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid5aQ3U108 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arid5aQ3U108 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms