Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Palb2Q3U0P1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Palb2Q3U0P1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Palb2Q3U0P1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Palb2Q3U0P1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palb2Q3U0P1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms