Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkl4Q3TZA2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkl4Q3TZA2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkl4Q3TZA2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms