Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn4clQ3TYX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrn4clQ3TYX2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrn4clQ3TYX2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrn4clQ3TYX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms