Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc17a7Q3TXX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc17a7Q3TXX4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc17a7Q3TXX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc17a7Q3TXX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms