Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms