Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2afvQ3THW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2afvQ3THW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afvQ3THW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2afvQ3THW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afvQ3THW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afvQ3THW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afvQ3THW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afvQ3THW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms