Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hs1bp3Q3TC93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hs1bp3Q3TC93 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hs1bp3Q3TC93 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hs1bp3Q3TC93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hs1bp3Q3TC93 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hs1bp3Q3TC93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hs1bp3Q3TC93 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms