Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KNL4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3KNL4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3KNL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3KNL4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3KNL4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3KNL4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3KNL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KNL4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3KNL4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3KNL4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3KNL4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3KNL4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3KNL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3KNL4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q3KNL4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3KNL4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms