Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fgfbp3Q1HCM0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fgfbp3Q1HCM0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms