Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myo3bQ1EG27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo3bQ1EG27 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myo3bQ1EG27 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo3bQ1EG27 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myo3bQ1EG27 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myo3bQ1EG27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1006.8 ms