Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpusd3Q14AI6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpusd3Q14AI6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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