Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cass4Q08EC4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cass4Q08EC4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cass4Q08EC4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cass4Q08EC4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms